MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Coding Repeats of Methanococcoides burtonii DSM 6242

Total Repeats: 40075

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
40001	NC_007955	TGG	2	6	2570806	2570811	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774350
40002	NC_007955	CAA	2	6	2570838	2570843	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91774350
40003	NC_007955	GTA	2	6	2570855	2570860	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774350
40004	NC_007955	ATTT	2	8	2570878	2570885	25 %	75 %	0 %	0 %	91774350
40005	NC_007955	TCT	2	6	2571056	2571061	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774351
40006	NC_007955	GTT	2	6	2571132	2571137	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91774351
40007	NC_007955	CAT	2	6	2571280	2571285	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91774351
40008	NC_007955	AAC	2	6	2571326	2571331	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	91774351
40009	NC_007955	CTT	2	6	2571337	2571342	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774351
40010	NC_007955	AGT	2	6	2571377	2571382	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774351
40011	NC_007955	T	6	6	2571462	2571467	0 %	100 %	0 %	0 %	91774351
40012	NC_007955	TCT	2	6	2571488	2571493	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774351
40013	NC_007955	GAG	2	6	2571514	2571519	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91774351
40014	NC_007955	CTTG	2	8	2571577	2571584	0 %	50 %	25 %	25 %	91774351
40015	NC_007955	TTA	2	6	2571600	2571605	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91774351
40016	NC_007955	TCT	2	6	2571636	2571641	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774351
40017	NC_007955	CCTG	2	8	2571645	2571652	0 %	25 %	25 %	50 %	91774351
40018	NC_007955	AGT	2	6	2571680	2571685	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774351
40019	NC_007955	GCCAT	2	10	2571773	2571782	20 %	20 %	20 %	40 %	91774351
40020	NC_007955	TCA	2	6	2571816	2571821	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91774351
40021	NC_007955	GA	3	6	2571899	2571904	50 %	0 %	50 %	0 %	91774351
40022	NC_007955	AG	3	6	2571914	2571919	50 %	0 %	50 %	0 %	91774351
40023	NC_007955	CTT	2	6	2571952	2571957	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774351
40024	NC_007955	ATA	2	6	2571981	2571986	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91774351
40025	NC_007955	TG	3	6	2572311	2572316	0 %	50 %	50 %	0 %	91774352
40026	NC_007955	GGT	2	6	2572344	2572349	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774352
40027	NC_007955	TGG	2	6	2572393	2572398	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774352
40028	NC_007955	TGG	2	6	2572426	2572431	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774352
40029	NC_007955	ATC	2	6	2572436	2572441	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91774352
40030	NC_007955	GCA	2	6	2572450	2572455	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	91774352
40031	NC_007955	GAGC	2	8	2572485	2572492	25 %	0 %	50 %	25 %	91774352
40032	NC_007955	ATG	2	6	2572522	2572527	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774352
40033	NC_007955	TGA	2	6	2572538	2572543	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774352
40034	NC_007955	AAT	2	6	2572591	2572596	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	91774352
40035	NC_007955	ATTT	2	8	2572721	2572728	25 %	75 %	0 %	0 %	91774353
40036	NC_007955	CAT	2	6	2572782	2572787	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91774353
40037	NC_007955	AC	3	6	2572852	2572857	50 %	0 %	0 %	50 %	91774353
40038	NC_007955	GAA	2	6	2572867	2572872	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91774353
40039	NC_007955	TGT	2	6	2572875	2572880	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91774353
40040	NC_007955	TGGTGA	2	12	2572905	2572916	16.67 %	33.33 %	50 %	0 %	91774353
40041	NC_007955	TTG	2	6	2572964	2572969	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91774353
40042	NC_007955	TGA	2	6	2572983	2572988	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774353
40043	NC_007955	TGG	2	6	2573003	2573008	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774353
40044	NC_007955	CT	3	6	2573011	2573016	0 %	50 %	0 %	50 %	91774353
40045	NC_007955	AGA	2	6	2573028	2573033	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91774353
40046	NC_007955	GGA	2	6	2573049	2573054	33.33 %	0 %	66.67 %	0 %	91774353
40047	NC_007955	TGGG	2	8	2573195	2573202	0 %	25 %	75 %	0 %	91774353
40048	NC_007955	GTA	2	6	2573314	2573319	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774354
40049	NC_007955	TCTT	2	8	2573377	2573384	0 %	75 %	0 %	25 %	91774354
40050	NC_007955	ATG	2	6	2573496	2573501	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774354
40051	NC_007955	ATGG	2	8	2573508	2573515	25 %	25 %	50 %	0 %	91774354
40052	NC_007955	AGA	2	6	2573543	2573548	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	91774354
40053	NC_007955	TAT	2	6	2573567	2573572	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91774354
40054	NC_007955	TGT	2	6	2573718	2573723	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	91774355
40055	NC_007955	GAT	2	6	2573762	2573767	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774355
40056	NC_007955	CAGT	2	8	2573809	2573816	25 %	25 %	25 %	25 %	91774355
40057	NC_007955	CTT	2	6	2573827	2573832	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774355
40058	NC_007955	T	7	7	2573897	2573903	0 %	100 %	0 %	0 %	91774355
40059	NC_007955	CATC	2	8	2573926	2573933	25 %	25 %	0 %	50 %	91774355
40060	NC_007955	TTC	2	6	2573987	2573992	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774355
40061	NC_007955	AT	3	6	2574273	2574278	50 %	50 %	0 %	0 %	91774355
40062	NC_007955	GAATT	2	10	2574293	2574302	40 %	40 %	20 %	0 %	91774355
40063	NC_007955	T	6	6	2574301	2574306	0 %	100 %	0 %	0 %	91774355
40064	NC_007955	GTG	2	6	2574322	2574327	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774355
40065	NC_007955	ATT	2	6	2574341	2574346	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	91774355
40066	NC_007955	TCT	2	6	2574404	2574409	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774355
40067	NC_007955	TGG	2	6	2574422	2574427	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	91774355
40068	NC_007955	A	6	6	2574442	2574447	100 %	0 %	0 %	0 %	91774355
40069	NC_007955	TGA	2	6	2574472	2574477	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	91774355
40070	NC_007955	CTT	2	6	2574478	2574483	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	91774355
40071	NC_007955	ATCT	2	8	2574569	2574576	25 %	50 %	0 %	25 %	91774355
40072	NC_007955	TCC	2	6	2574623	2574628	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	91774355
40073	NC_007955	CAT	2	6	2574718	2574723	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	91774355
40074	NC_007955	T	6	6	2574753	2574758	0 %	100 %	0 %	0 %	91774355
40075	NC_007955	TCAA	2	8	2574789	2574796	50 %	25 %	0 %	25 %	91774355

< Previous12...69707172737475767778798081Next >

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.